Panti Asuhan Yatim Putra Muhammadiyah Yogyakarta merupakan panti asuhan tertua di Indonesia. Kelahiran Panti ini diawali dengan gencarnya dakwah yang dilancarkan oleh KH. Ahmad Dahlan pada tahun 1917 mengenai pentingnya memperhatikan dan menyantuni anak-anak yatim serta fakir miskin dan anak-anak terlantar. Hal ini sesuai dengan ajaran Islam yang tertuang dalam Al Qur'an surat Al Ma'un. Usaha ini akhirnya dapat membangkitkan semangat dan kesadaran umat islam untuk lebih memperhatikan nasib anak-anak yatim. Hampir setiap hari umat Islam yang berkecukupan berbondong-bondong menuju alon-alon kota kerajaan untuk menyisihkan sebagian harta bendanya guna memberikan pada anak-anak yatim dan fakir miskin yang telah dikumpulkan disana. Pada tahun 1918 lahirlah organisasi otonom Muhammadiyah yang diberi nama Penolong Kesengsaraan Oemoem (PKO). Organisasi inilah yang merealisasikan bentuk kegiatan penyantunan anak yatim ini menjadi suatu wadah organisasi yaitu : Panti Asuhan Yatim Muhammadiyah Yogyakarta, yang secara resmi didirikan pada tahun 1921. Pada awalnya Panti Asuhan ini belum dipisahkan antara anak asuh laki-laki dengan anak asuh perempuan. Baru pada tahun 1928 hingga sekarang ini menjadi dua, yaitu Panti AsuhanYatim Putra Muhammadiyah Yogyakarta dan Panti Asuhan Aisyiah Yogyakarta.
